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Die Transkription

Aufgabe der Transkription

Die Aufgabe der Transkription besteht in der Bereitstellung einer Arbeitskopie eines DNA-Abschnitts, zum Beispiel eines Strukturgens. Diese Arbeitskopie in Form einer mRNA wird dann von den Ribosomen in ein Protein übersetzt. Aber auch die ribosomale RNA - die rRNA - die ein wichtiges Strukturelement der Ribosomen darstellt, muss durch Transkription der entsprechenden DNA-Abschnitte bereitgestellt werden. Und auch die tRNA-Moleküle einer Zelle entstehen nicht einfach so, sondern durch Transkription entsprechender DNA-Bereiche. Vieles ist noch ungeklärt, was die Transkription der DNA angeht. Werden alle Abschnitte der DNA transkribiert? Was ist mit der so genannten "Schrott-DNA", die sich zwischen den Genen befindet und die sogar den größten Teil der DNA ausmacht?

Unterschied Transkription - Replikation

Die Transkription ist im Grunde eine abgewandelte Replikation. Allerdings mit einigen Unterschieden:

Erstens

Zweitens

Drittens

Viertens

Ablauf der Transkription

Das wichtigste Enzym bei der Transkription ist die RNA-Polymerase, die von der Funktionsweise durchaus mit der DNA-Polymerase gleichzusetzen ist. Wie wir aber gerade gesehen haben, wird bei der Transkription nicht die gesamte DNA kopiert, sondern nur der Teil, der für die Synthese eines Proteins (oder einer Gruppe von Proteinen) verantwortlich ist, ein so genanntes Gen (oder Operon). Dazu muss die RNA-Polymerase den Anfang dieses Genes bzw. Operons finden. Eine menschliche Zelle hat 46 DNA-Stränge im Zellkern, wobei jeder ein paar Millionen Basenpaare lang ist. Wie soll die RNA-Polymerase da den Anfang eines

Aufbau eines Operons

Ein Operon ist sozusagen die kleinste funktionale Einheit der DNA. Man könnte auch sagen: Ein Operon ist eine Gruppe zusammengehöriger Gene mit einem gemeinsamen Ein/Ausschalter.

Promotor

Am Anfang eines jeden Operons befindet sich der Promotor. Das ist ein kurzer DNA-Abschnitt, der durch eine bestimmte Basenabfolge gekennzeichnet ist, in der die Buchstaben T und A besonders häufig vorkommen. Vor allem die Basensequenz / das "Motiv" TATATT findet sich hier. Der Promotor ist die Andockstelle für die RNA-Polymerase.

Ein Grund für das gehäufte Vorkommen der Basen T und A ist sicherlich, dass sich zwischen T- und A-Basen nur zwei Wasserstoffbrücken ausbilden. T- und A-reiche DNA-Regionen können also besonders leicht aufgetrennt werden, und das ist ja auch der erste wichtige Schritt bei der Transkription der DNA. Am Promotor kann die DNA-Doppelhelix also wegen der vielen T- und A-Basen besonders leicht in Einzelstränge gespalten werden (Spektrum der Wissenschaft, März 2014, Seite 20).

Operator

Als nächstes kommt die Operator-Region. An diese DNA-Region kann sich nach dem Schlüssel-Schloss-Prinzip ein spezifisches Repressor-Protein andocken. Sitzt ein solches Repressor-Protein am Operator, so ist der Weg für die RNA-Polymerase blockiert und eine Transkription ist nicht möglich. Hier hat die Zelle eine effektive Methode erfunden, mit der sie die Transkription von Genen verhindern kann, die gerade nicht benötigt werden.

Strukturgene

An den Operator schließen sich die "richtigen" Gene an, die für die Proteine verantwortlich sind. Solche Gene bezeichnet man auch als Strukturgene.

Terminator

Genau so wie der Anfang eines Genes besonders gekennzeichnet werden ist, muss auch das Ende eines Transkriptionsabschnittes markiert werden. Eine solche spezifische Basenabfolge bezeichnet man auch als Terminator.

Der Transkriptionsvorgang

Die RNA-Polymerase diffundiert im Kernplasma herum und kommt irgendwann mit einem DNA-Strang in Kontakt. Das Enzym setzt sich dann auf die DNA-Doppelhelix wie eine Lokomotive auf einen Schienenstrang. Sie gleitet jetzt auf der DNA entlang. Sobald die RNA-Polymerase auf eine Promotor-Sequenz stößt, entsteht eine stabilere Bindung. Einen Promotor erkennt die RNA-Polymerase an dem typischen TATATT-Motiv (unter anderem).

Wenn der Operator, der sich meistens direkt hinter dem Promotor befindet, nicht durch ein Repressor-Protein blockiert ist, beginnt die RNA-Polymerase mit der Transkription. Die Basen der Strukturgene werden in mRNA übersetzt. Bei Prokaryoten setzen sich sofort Ribosomen an die entstehende mRNA und beginnen mit der Translation. Bei Eukaryoten geht das nicht so schnell. Die mRNA muss nämlich zuerst den Zellkern verlassen. Erst dann können sich Ribosomen an die mRNA setzen und mit der Translation beginnen.

Wenn die RNA-Polymerase am Terminator ankommt, stoppt die Transkription, und das Enzym verlässt die Doppelhelix. Die Polymerase diffundiert jetzt wieder ziellos im Kernplasma herum, bis sie erneut zufällig in Kontakt mit der DNA kommt.

Der Transkriptionsvorgang - näher betrachtet

Zunächst wird die DNA-Doppelhelix über eine Länge von mehreren Basenpaaren entwunden. Eine der beiden Einzelstränge ist dann die Kopiervorlage für die mRNA; dieser Einzelstrang wird dann als codogener Strang bezeichnet. An diesen Strang werden jetzt nach und nach die RNA-Nucleotide angehängt. Genauer gesagt, handelt es sich um Nucleotide mit drei Phosphatgruppen, denn der Vorgang der Elongation (Verlängerung der mRNA) ist sehr energieaufwändig, und die RNA-Nucleotide bringen diese Energie selbst mit, in Form von zwei Phosphatgruppen, die dann abgespalten werden (ähnlich wie bei der Spaltung von ATP in AMP und 2 Phosphat).

Die RNA-Polymerase bewegt sich bei diesem Prozesse stetig weiter. Es bildet sich ein genau 9 Basenpaare langer DNA-mRNA-Hybrid-Doppelstrang. Bei der zehnten Base werden die H-Brücken zwischen dem DNA-Nucleotid und dem komplementären RNA-Nucleotid gesprengt, und die mRNA löst sich von dem codogenen Strang.

Kopierfehler kommen vor

Manchmal macht die RNA-Polymerase einen Kopierfehler und hängt ein falsches RNA-Nucleotid an das 3'-Ende der wachsenden mRNA-Kette. Wenn die RNA-Polymerase diesen Fehler bemerkt, geht sie quasi ein kleines Stück zurück, das falsche RNA-Nucleotid wird durch einen speziellen Transkriptionsfaktor abgeschnitten und wird dann durch das korrekte RNA-Nucleotid ersetzt.

Interne Links:

RNA

Promotoren

Externe Links:

Transkription von mRNA: In der Pause liegt die Kraft
Ein Forschungsbericht der Max-Planck-Gesellschaft von 2008

Transkription bei Pro- und Eukaryoten
Eine Veröffentlichung der Hochschule Ulm

10 Jahre RNA-Polymerase-Struktur
von Transkription zu Genregulation
Ein Artikel aus Biospektrum 1/2010.

Literatur:

Spektrum der Wissenschaft 3/2014, Seite 20